Facteurs de risque de colonisation par Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline chez des patients admis dans un hôpital urbain: apparition d’un transport nasal de SARM d’origine communautaire

Contexte Les cultures de surveillance réalisées à l’admission hospitalière ont été recommandées pour identifier les patients colonisés par Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline mais nécessitent des ressources substantielles. Nous avons déterminé la prévalence et les facteurs de risque de colonisation à SARM au moment de l’hospitalisation. Méthodes d’hospitalisation Les cultures de narines antérieures ont été obtenues après l’admission pendant une période de cinq mois. Une étude cas-témoin et des études de typage moléculaire ont été réalisées. Résultats Un total de% de patients avaient une culture de nare positive pour SARM, et% S aureus sensible à la méthicilline En analyse multivariée, les facteurs de risque de colonisation par le SARM comprenaient l’utilisation d’antibiotiques dans les mois précédant l’odds ratio d’admission [OR],; % intervalle de confiance [IC], -, hospitalisation au cours des derniers mois OU; % IC, -, diagnostic d’une infection de la peau ou des tissus mous à l’admission OU,; % IC, -, et l’infection par le VIH Un total de% des patients cas colonisés par SARM a eu au moins de ces facteurs de risque indépendants, contrairement à% des patients du groupe témoin; % CI, – Le typage moléculaire a démontré que% des isolats de MRSA nares% des isolats appartenaient à la communauté de SARM associée à la communauté américaine SARM CA-MRSAConclusion La prévalence de la colonisation de SARM au moment de l’admission était élevée% Limitation des cultures de surveillance aux patients ⩾ des facteurs de risque identifiés peut permettre un dépistage ciblé L’émergence de la colonisation par le SARM-CA représente un nouveau réservoir de SARM non reconnu dans les hôpitaux, augmentant potentiellement le risque de transmission horizontale

Les infections à SARM Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline sont devenues de plus en plus problématiques dans les milieux de soins et dans la communauté Les données du réseau national de surveillance des infections nosocomiales des CDC ont montré que les SARM représentent>% des souches S aureus causant des infections nosocomiales chez les patients. Dans les unités de soins intensifs Les données du programme de surveillance antimicrobienne SENTRY ont confirmé des taux croissants de résistance à la méthicilline parmi les isolats de S aureus dans le monde, tant dans les infections nosocomiales que communautaires . Infections à SARM CA-MRSA associées La reconnaissance et l’isolement des personnes colonisées ou infectées par le SARM sont recommandés pour minimiser la propagation du SARM dans les hôpitaux. Les recommandations récentes publiées par la Society for Healthcare Epidemiology of America recommandent des cultures de surveillance au moment de l’infection. admission à l’hôpital Les facteurs de risque associés à un risque accru d’acquisition nosocomiale de SARM sont bien connus Un nombre limité d’études ont tenté de déterminer les facteurs de risque de colonisation par le SARM à l’admission à l’hôpital [- ont été menées principalement dans des centres de soins tertiaires et avant l’émergence généralisée d’infections à SARM. On ne sait pas si les facteurs de risque de colonisation par SARM sont homogènes entre différentes populations ou si la colonisation par SARM est associée à un ensemble différent de facteurs de risque. L’objectif de notre étude était de déterminer la prévalence et les facteurs de risque de la colonisation par le SARM chez les patients admis dans un grand hôpital public urbain pendant une période où l’infection par CA-MRSA était de plus en plus répandue. des souches de CA-MRSA

Méthodes

Population étudiée et collecte de données L’étude a été menée à l’hôpital public Grady Memorial, à Atlanta, en Géorgie. L’étude a été approuvée par le comité d’examen institutionnel de l’Université Emory et le comité de surveillance de la recherche Grady. Juin et juillet, les spécimens des narines antérieures de tous les patients admis à l’hôpital le dimanche, mardi ou jeudi sauf pour les patients admis au service de psychiatrie ou à l’unité de brûlure ont été obtenus pour culture après hospitalisation. Données sur les caractéristiques démographiques, antécédents médicaux , hospitalisations antérieures ou visites à la clinique, utilisation d’antibiotiques au cours de l’année précédente, antécédents de SARM, type de logement et antécédents d’incarcération au cours de la dernière année proviennent de dossiers hospitaliers, pharmaceutiques et de microbiologie ou directement des patients. obtenus à partir de dossiers de pharmacie informatisés et d’entrevues avec des patients Patients qui se sont décrits Les personnes qui vivaient dans des foyers de soins personnels, des maisons de soins infirmiers, des établissements de soins de longue durée, des établissements correctionnels ou d’autres hôpitaux ou qui étaient sans abri étaient classées comme vivant. Becton-Dickinson Des écouvillons ont été étalés sur des plaques de sel de mannitol Becton-Dickinson à ° C pendant h Des colonies jaunes ont été striées sur des plaques de gélose au sang Becton-Dickinson et incubées à ° C pendant Becton-Dickinson La sensibilité à l’oxacilline a été déterminée en évaluant la croissance sur agar Mueller-Hinton avec% NaCl et μg / mL d’oxacilline à ° C pendant h selon les directives NCCLS [ ,] Etudes de typage moléculaire PFGE a été réalisée sur tous les isolats de MRSA comme décrit par Bannerman et al Restriction a été réalisée avec Sm aI Roche Molecular Biochemicals Les photographies de gel ont été numérisées et sauvegardées en tant que fichier tiff pour analyse avec le logiciel BioNumerics Applied Maths L’analyse des grappes a été effectuée en utilisant une méthode de groupes de paires non pondérée basée sur des coefficients de Dice. Pour l’analyse de la déformation visuelle, les isolats ont été considérés comme différents si les patrons PFGE différaient de & gt; Les isolats de SARM ont été définis comme ayant des génotypes CA-MRSA si PFGE démontrait soit des PFT USA ou USA selon la méthode décrite par McDougal et al MRSA isolats avec d’autres PFT ont été considérés comme ayant des génotypes associés aux soins HA-MRSASCCmectyping et Analyse du gène PVL de la leucocidine Panton-Valentine Le type SCCmec a été déterminé par typage PCR du complexe du gène mec, comme décrit par Okuma et al La présence de gènes PVL dans SARM a été évaluée par PCR, comme décrit par Lina et al Antimicrobien Tests de sensibilité Les tests de sensibilité aux antimicrobiens in vitro ont été réalisés selon la méthode NCCLS Étude cas-témoins Une étude cas-témoins a été réalisée pour identifier les facteurs de risque de colonisation par SARM. La culture a révélé une colonisation par le SARM Les témoins ont été définis comme des patients qui n’étaient pas colonisés par le SARM, c’est-à-dire qui étaient soit colonisés par des souches sensibles à la méthicilline. S aureus [MSSA] ou ont eu des résultats négatifs de cultureStatistical analysis Données ont été saisies dans Microsoft Access logiciel Microsoft Corporation et exportés dans le logiciel SAS, version SAS Institute, qui a été utilisé pour les analyses de données Identification des facteurs de risque potentiels pour la colonisation MRSA a été initialement déterminée Les variables statistiquement significatives associées à la colonisation par SARM en analyse univariée ont été entrées dans un modèle de régression logistique inconditionnelle multivariée contrôlant l’âge, le sexe et la race. Le modèle final a été dérivé en incorporant une approche d’élimination rétrograde progressive. Les termes d’interaction et la colinéarité ont été évalués. La qualité de l’ajustement du modèle final a été évaluée à l’aide du test d’adéquation Hosmer-Lemeshow. La valeur AP de ⩽ a été définie comme statistiquement significative.

Résultats

Prévalence de la colonisation nasale par MRSA Les spécimens de Nares ont été obtenus pour la culture de% des patients admis à l’hôpital pendant la période d’étude. Les cultures ont été exclues à cause d’écouvillonnages mal étiquetés, produisant des cultures de narines. aux services exclus de notre étude, les patients ont refusé de participer, et les patients restants n’étaient pas disponibles pour la culture nares après l’admission en raison du congé hospitalier ou de l’absence de leur chambre pour les procédures ou les études diagnostiques des cultures nares,% étaient positifs pour SARM,% étaient positifs pour MSSA, et% étaient culture négative MRSA représentait% des isolats de S aureus Parmi les patients infectés par le VIH, la prévalence de la colonisation SARM était de%, contrairement à% des personnes séronégatives pour le VIH; % CI, -; P & lt; figure Seulement% des cas colonisés par le SARM ont été admis avec ou ont développé une infection à SARM confirmée en laboratoire pendant l’hospitalisation; de ceux-ci avaient bactériémie Un total de cas avait un diagnostic d’une infection de la peau et des tissus mous à savoir, la culture confirmée et avec un diagnostic clinique, comme indiqué dans le tableau

Figure Vue étendueDétection, inscription et prévalence de la colonisation nasale avec Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline SARM Les types prédominants de champs pulsés récupérés à partir d’isolats nasaux sont présentés, les États-Unis représentant%, USA pour% et USA pour% La prévalence de la colonisation nasale par SARM, stratifiée en fonction du statut de l’infection par le VIH, du SARM CA, du SARM acquis dans la communauté, de la S aureus sensible à la méthicilline, figure parmi les autres isolats de SARM des spécimens nares. La prévalence de la colonisation nasale avec Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline MRSA Les types prédominants de champs pulsés récupérés à partir d’isolats nasaux sont indiqués, USA représentant%, USA pour% et USA pour% de tous les isolats de MRSA provenant de nares. les autres PFT représentaient le% B restant, Prévalence de la colonisation nasale par SARM, stratifiée en fonction de l’infection par le VIH CA-MRSA, SARM d’origine communautaire, SASM, S aureus sensible à la méthicilline

Tableau View largeTélécharger slideCaractéristiques des patients admis à Grady Memorial Hospital Atlanta, GA et résultats de l’analyse univariée des facteurs de risque de colonisation nasale avec Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline MRSATable View largeTélécharger slideCaractéristiques des patients admis à Grady Memorial Hospital Atlanta, GA et résultats de l’analyse univariée des facteurs de risque de colonisation nasale avec Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline MRSAR facteurs facilitant la colonisation nasale par SARM Les caractéristiques démographiques et cliniques comparatives sont montrées dans le tableau En analyse univariée, les patients avec colonisation SARM étaient similaires aux patients sans colonisation SARM par rapport à l’âge, la race, sexe, présence de diabète et nombre de visites cliniques au cours de l’année précédente Les facteurs de risque de colonisation par SARM en analyse univariée sont présentés dans le tableau En analyse multivariée, les facteurs associés indépendamment à un risque accru de colonisation par SARM sont inclus hospitalisation au cours des derniers mois OU; % IC, -, la présence d’une peau ou d’une infection des tissus mous à l’admission OU; % CI, -, utilisation d’antimicrobiens dans les mois précédant l’admission et tableau de statut séropositif au VIH L’infection par VIH était associée à un risque accru de colonisation par le SARM chez les personnes infectées par le VIH n’ayant pas reçu d’antibiotiques dans les mois précédant l’admission actuelle. % CI, -, mais pas chez les personnes séropositives pour le VIH qui avaient reçu des antibiotiques dans les mois précédant l’admission OU; % IC, – L’utilisation d’antimicrobiens dans les mois précédant l’admission à l’hôpital était associée à un risque plus élevé de colonisation par le SARM chez les personnes séronégatives que chez les personnes séronégatives qui n’avaient pas reçu d’antibiotiques dans les mois précédant l’hospitalisation. % CI, – table

Table View largeTélécharger une analyse multivariée des facteurs de risque associés à la colonisation Staphylococcus aureus résistante à la méthicilline chez les patients récemment admis à l’hôpital Grady Memorial Atlanta, GATable Agrandir l’imageTableau de lectureAnalyse multivariée des facteurs de risque associés à la colonisation par Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline chez les patients récemment admis à Grady Memorial Hospital Atlanta, GA Des analyses complémentaires ont évalué les facteurs de risque de colonisation des SARM sur la base du génotype. L’infection de la peau et des tissus mous était un facteur de risque indépendant de la colonisation par CA-MRSA USA. % IC, -, alors que l’hospitalisation au cours des derniers mois OU; % IC, – et utilisation d’antimicrobiens chez les patients séronégatifs pour le VIH OU; % CI, – étaient des facteurs de risque indépendants pour la colonisation des nares avec des génotypes HA-MRSA L’infection par VIH était un facteur de risque indépendant à la fois pour les SARM-SAR et HA-SARM. facteurs de risque identifiés dans l’analyse multivariée, comparé au% de témoins qui n’ont pas été colonisés par SARM OU; % CI, – Les cas et les témoins ont été comparés pour évaluer l’impact du nombre de facteurs de risque indépendants sur la probabilité de colonisation par le SARM. Une relation dose-réponse significative a été démontrée entre la colonisation par SARM et le nombre de facteurs de risque présents. , par le χ test de tendance linéaire en proportions

Figure Vue largeDownload slideAssociation entre le nombre de facteurs de risque indépendants présents et la colonisation avec Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline P & lt; , par le χ test pour la tendance du revêtement en proportionsFigure View largeDownload slideAssociation entre le nombre de facteurs de risque indépendants présents et la colonisation avec Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline P & lt; , par le χ test de la tendance du revêtement en proportions Typage moléculaire et génétique Le typage moléculaire a révélé que% des isolats groupés en motifs PFGE ou PFTs figuraient parmi ces isolats USA [%] d’isolats, USA [%] et USA [%] de La prévalence globale de la colonisation par CA-MRSA avec la PFT USA chez les patients admis dans notre institution était de% de SCCmec IV et les gènes PVL ont été identifiés dans% des isolats USA; l’isolat américain restant portait SCCmec II et manquait de gènes PVL

Figure Vue grandDownload slideDendrogramme gauche des types de champs pulsés représentatifs PFTs pour Staphylococcus aureus résistant à la méthicine MRSA isolats provenant de cultures de nares spécimens obtenus à partir de patients admis à Grady Memorial Hospital à Atlanta, voies de Géorgie,,, et, et pour le type standard SARM représentatif souches précédemment publiées par les centres de contrôle et de prévention des maladies, et Trois PFT prédominantes ont été observées dans les isolats prélevés dans les cultures de nares instillation. Les PFT prédominants étaient des isolats des États-Unis [%]; voies et, USA [%] de; voie, et USA [%] de; voies et Figure View largeTélécharger slideDendrogramme gauche des types de champs pulsés représentatifs PFTs pour Staphylococcus aureus résistant à la méthicine MRSA isolats de cultures de nares spécimens obtenus à partir de patients admis à Grady Memorial Hospital à Atlanta, Georgia,,,, et, pour SARM représentatif [3 souches de PFT prédominantes ont été observées dans les isolats prélevés dans les cultures de nares. Les PFT prédominants étaient des isolats des États-Unis [%]; voies et, USA [%] de; voie, et USA [%] de; Les résultats de sensibilité aux antimicrobiens des isolats de MRSA selon la PFT sont présentés dans le tableau Tous les isolats américains étaient résistants aux β-lactames et à l’érythromycine et étaient sensibles à la clindamycine, au triméthoprime-sulfaméthoxazole, à la rifampine, à la gentamicine et à la vancomycine. étaient sensibles à la ciprofloxacine Susceptibilité des isolats de SARM ayant un génotype associé aux soins de santé, c.-à-d. les génotypes autres que les États-Unis ou les États-Unis sont indiqués dans le tableau

Tableau View largeTélécharger Diagrammes de sensibilité aux antibiotiques d’isolats de Staphylococcus aureus résistants à la méthicilline obtenus à partir de cultures de narines, selon le type de champ pulséTable View largeTélécharger Diagrammes de susceptibilité antibiotiques des isolats de Staphylococcus aureus résistants à la méthicilline

Discussion

Des rapports récents ont noté l’émergence d’infections à SARM-CA, en particulier d’infections de la peau et des tissus mous et de foyers de maladie à SARM-CA chez des personnes ne présentant pas de facteurs de risque traditionnels de SARM [ -] Cependant, les rapports de colonisation nasale avec le clone CA-MRSA USA ont été limités Parmi ces derniers rapports, il y avait une hétérogénéité significative dans la définition de CA-MRSA, avec la majorité des définitions reposant sur le moment de l’isolement de S aureus, et le typage moléculaire n’a pas été réalisé dans toutes les études Dans notre étude, nous avons démontré par un typage moléculaire qu’une proportion significative de personnes admises dans un hôpital urbain sont colonisées par le clone CA-MRSA USA, avec un pourcentage de ces souches portant des gènes PVL et les isolats SCCmec IV alleleCA-MRSA USA ont été plus souvent retrouvés dans les narines des patients admis avec la peau et les tissus mous. Une explication possible des raisons pour lesquelles le clone CA-MRSA USA est plus susceptible de conduire à une infection clinique, en particulier aux infections de la peau et des tissus mous, est le fait que les souches USA contiennent généralement des PVL. En général, chez les recrues militaires, un risque accru de développer une infection des tissus mous a été observé chez les patients colonisés par le SARM-CA, comparativement à ceux qui sont colonisés par le SASM. Dans notre étude ,% des patients colonisés par le génotype CA-MRSA USA dans leurs narines n’avaient pas d’infection cliniquement apparente au moment de l’admission; des études prospectives seraient nécessaires pour déterminer si les personnes colonisées par ce clone sont exposées à un risque accru de développer des infections, comparativement aux personnes colonisées par des génotypes associés aux soins de santé.L’émergence de CA-MRSA est une cause fréquente d’infections staphylococciques et de colonisation Les facteurs de risque indépendants de la colonisation par SARM identifiés ici ont été observés chez% des patients colonisés par CA-MRSA USA, ce qui suggère que des antécédents de Cependant, les facteurs de risque que nous avons identifiés permettraient toujours d’identifier les personnes colonisées par le SARM, quel que soit le génotype de la souche de colonisation. Le paradigme antérieur pour le SARM l’acquisition était que cela s’est produit dans les soins de santé s Ce n’est plus exclusivement le cas, étant donné l’émergence du SARMococératinococcique Bien que la plupart des patients colonisés par des génotypes de SARM associés à des soins de santé puissent continuer à être acquis dans des établissements de soins de santé, nous soupçonnons que l’acquisition du Le clone SARM USA est présent à la fois dans la communauté et dans le cadre des soins de santé. Le soutien de cette hypothèse provient de la forte prévalence de CA-MRSA USA observée dans les infections de la peau et des tissus mous de S aureus à Atlanta. acquisition de la communauté , et des preuves que les infections nosocomiales sont maintenant causées par CA-MRSA Notre étude est sujette à certaines limitations Parmi les patients éligibles au dépistage,% n’étaient pas disponibles pour avoir une culture nare réalisée après l’hôpital admission, ce qui crée un potentiel de biais de sélection Nous croyons que le biais de sélection était minime, parce que les patients qui n’avaient pas de culture de nare ne différaient pas Nos données ont été collectées dans un hôpital urbain public avec une forte prévalence de l’infection à VIH Ainsi, la généralisation de ces résultats à d’autres populations doit être faite avec précaution. Enfin, la relation temporelle entre la colonisation par le SARM et l’acquisition des facteurs de risque signalés est inconnue, car cette étude a évalué la prévalence de la colonisation à un moment précis. En résumé, nous avons identifié une forte prévalence de la colonisation par SARM chez les patients admis dans un hôpital urbain. Les cultures cliniques de SARM ne représentent que la pointe de l’iceberg du fardeau global de SARM dans notre hôpital. Dans notre établissement, limiter les cultures de surveillance aux patients présentant ⩾ des facteurs de risque identifiés. peut permettre un dépistage ciblé conçu pour maximiser la reconnaissance de la colonisation par le SARM tout en réduisant la besoins logistiques et ressources financières requises Enfin, nous avons démontré qu’un nombre significatif de patients% de tous les adultes admis à l’hôpital sont colonisés par le clone CA-MRSA USA au moment de l’admission, ce qui représente un réservoir émergent et de plus en plus problématique de SARM dans Hôpitaux américains

Remerciements

Soutien financier Emory Medical Care Foundation à MDK, Emory Mentorée Programme de chercheurs cliniques de recherche, National Institutes of Health NIH Centre national de ressources de recherche subvention KRR à HMB et MDK, et NIH Institut national des maladies allergiques et infectieuses accorder K AI à MDKPotentiel conflits de intérêt Tous les auteurs: pas de conflits